1.取樣
拿到樣品后用毛細管蘸取少量的樣品放入離心管中，加入相應的溶劑將樣品溶解，標號后作為對照。
2.跑板
將取出的樣品與要分離的樣品點在同一塊硅膠板上進行跑板，確定第幾個點是將要分離出來的樣品。
3.裝柱
將少量的棉花（棉花太少會露出硅膠，太多過濾的較慢）塞入柱子低端防治硅膠露出，配制硅膠溶劑時濃度應適當（濃度過大易造成干柱，溶度過小會大量浪費溶劑），將硅膠裝入柱子直徑的15—20倍高即可（柱子過高浪費時間且沒有必要，柱子過低會造成物質沒有分離開就應經被洗下）。
倒入一定量的硅膠之后將硅膠壓實，然后將溶液壓**和硅膠面向近處，重復加入硅膠到達預定的高度，然后加入一定量的無水硫酸鈉（作用是防治在加樣時將硅膠面沖的變形），然后用手稍微彈動柱子將無水硫酸鈉彈平，在溶劑將柱內壁的硅膠及無水硫酸鈉洗凈。
4.加樣
將樣品用溶劑溶解后加入柱內（加入溶液時從中間像外圈旋轉滴加，不要將柱面沖出坑），并用溶劑反復洗瓶子3遍左右（洗瓶子時將溶劑沿磨砂口加但不能碰到瓶內壁，否則會污染試劑），將洗后的液體轉移**柱子內。
5.過柱
先用滴管沿柱內壁加入溶液，溶液到達一定高度后再將配制的溶液倒入到柱子上面的球型漏斗內，加壓，先用錐形瓶接取前面柱內的溶劑，然后當溶液到達一定的高度時開始用試管接，然后不斷的檢驗試管中是否有樣品洗出，當從有樣品洗出到沒有時，**個樣品就被*洗出，跳躍的點一定數量的點，然后進行跑板，確定沒有自己要分離的樣品后就可以倒掉，繼續洗柱子。換取極性稍大的溶劑，分離到第二個樣品后同**個做同樣的處理，直**得到自己要的樣品。
6.旋干
將的的樣品轉移**圓底瓶中旋干，在將樣品瓶安裝好后，先打開冷凝系統和加熱系統，然后打開旋轉和抽氣，緩慢關閉活塞，此時不停的觀察是否有氣泡，若有氣泡應放入一定氣體，然后緩慢關閉直**沒有氣泡，旋干后用油泵抽氣（油泵的真空度比選轉蒸發儀的真空度更大，能抽的更干）然后放入稱量過質量的小瓶中，封口后放入冰箱內保存。
